гумрал, mkvToolNix > утилита mkvMerge
Загружаешь свой файл > вкладка Global > в строке timecodes ставишь время начала и конца сэмпла через запятую и без пробелов: 00:23:13,00:25:00
Сохраняешь. Получишь три файла, в т.ч. нужный тебе вырезанный фрагмент.